Secondo l'Organizzazione Mondiale della Sanità, l'acqua contaminata può influire sulla digestione, sui livelli di energia e sul sistema immunitario. Anche se l'acqua non è contaminata in modo pericoloso, una scarsa idratazione dovuta al cattivo sapore o all'odore sgradevole può causare mal di testa, affaticamento e affaticamento renale. L'acqua dura, che contiene alti livelli di calcio e magnesio, può causare secchezza della pelle, danni ai capelli e calcoli renali in alcune persone.
L'esposizione a lungo termine ad acqua non sicura può aumentare il rischio di malattie come il cancro, problemi cardiaci e danni ai reni. I metalli pesanti come il piombo, l'arsenico o il mercurio presenti nell'acqua potabile possono contribuire al declino cognitivo, a disturbi neurologici, a squilibri ormonali e ad un aumento del rischio di cancro, a causa delle sostanze chimiche provenienti dalle attività industriali e agricole che si infiltrano nelle fonti idriche.
L'accumulo di microrganismi è una delle principali cause di molte malattie trasmesse dall'acqua, come il colera, la dissenteria, l'epatite A, il tifo, la poliomielite e malattie parassitarie come la schistosomiasi.